泰和四年（1204年）撤盈州，恢复原宝纸县制。

至宁元年（1213年）八月，海水不涨潮，宝抵盐使司惧亏课。九月复潮。

贞祐二年（1214年）刘永昌领导的农民起义军一部占据宝纸。刘称王后，建元天赐，设官定制。其礼部为其宝低县官制发“宝坻监判官印”。后起义失败，刘永昌下落不详。
元 至元元年（1264年）县内农民大饥，放赈米两月。
至元二年（1265年）县内增设三岔、丰财二盐场，连同后唐赵德钩所建的芦台盐场，县内盐场达3个。
至元十六年（1279年）元世祖忽必烈推行屯田制、编调大都（驻所在今北京）所属各县农民300户，拨地4.5万亩立屯于宝坻县，所收粮食全部向朝廷太仓及醴源仓输纳。此类田壤，至明代即称之为“边地”。
朝廷对蓟运河（三岔口以上段）进行疏导加固，这是历史上第一次对蓟运河实施防洪治理工程。
至元十九年（1282年）蝗虫危害禾稼，所至蔽道，人不能行，并入人屋室，造成大灾，县民大饥。
至元二十六年（1289年）闰十月，宝纸洼地大水，屯、田被淹。
至元二十九年（1292年）民大饥，宫府被迫发通州河西务粟娠之。

至元三十年（1293年）籍属宝坻、致仕回乡的中书省左丞刘深在宣慰使都元帅朱斌（同乡）、御史普颜等人赞助下，于县衙东北隅之古植盐院（今新修文庙处）建学宫。
延祐二年（1315年）七月，县内大水。
泰定三年（1326年）七月，县内出现大风雹，灾害所及之处，庄稼被刮倒，树木被折断。
至正十一年（1351年）四月，前任县官黑厮彦明、时任县尹曹居仁等与同僚各捐俸修五百缗，重修孔庙之大成殿、讲堂、斋舍，并创建东西两庑十六楹等。翌年七月落成。
明洪武元年（1368年）元、明两军征战，县内一度成为其战场，原县衙被烧毁。
洪武三年（1370年）知县荆志将县衙迁到城内西南隅（今米面加工厂处），与丞簿厅合为一所，并进行了扩建。
洪武七年（1374年）在知县何文信倡导下，于学宫右侧建“射圃亭”，供诸生学习骑射之用。当年十二月动工，次年二月告成。县民王原、王守道为建亭各捐地若干。
洪武十四年（1381年）按朝廷颁布的法令，为便于向民间征派三大徭役（里甲、杂泛、均徭），宝纸县始造赋役黄册，编排里甲。
洪武二十四年（1391年）朝廷命燕王督诸将屯田，宝纸、蓟州、沧州、南皮一带大量土地成为军队之屯田。
建文二年（1400年）为加强军事防务，在宝纸县梁城（1731年划属宁河县，今称宁河镇）设守御千户所，兵员1120人。
建文三年（1401年）燕王朱棣为夺取帝位而与惠帝朱允炆之间发生的战乱殃及宝纸县。
永乐元年至二十二年（1403-1424年）朝廷向宝纸县增派新的徭役—一孳生马、贡银鱼。其中之贡银鱼，规定“岁差入贡九次”，后即由“尚膳监”派中官于县内北潭等处设厂，专门督办向朝廷贡银鱼之事。其“柴薪银”、“桩木银”以及其他一切费用皆由县民负担，每年耗费不下千两白银。

洪熙元年（1425年）六月二十二日，天降暴雨，河水漫溢，潮白河河西务、宋家口堤岸冲决，洪水淹及宝坻。
宣德三年（1428年）六月，深雨连旬，潮白河之河西务堤岸冲决，伤民田禾，宝坻被灾。
正统元年至十四年（1436-1449年）元年（1436），县内依令改里役法为按了摊粮。
四年（1439）六月，潮白河水决河西务堤岸，顺天府抽宝纸县民夫参加修筑。
七年（1442）七月，潮白河上码头等堤岸冲决32处，武清县耍儿渡尤甚。洪水危及宝坻。
十三年（1448），县民周本家中一马生角，长二寸。
期间，县教谕高德撰写《宝坻县志》二卷，属于草稿，未能刊印。
景泰元年至七年（1450-1456年）朝廷改县内徭役名目之一一孳生马为寄养马，为数2049匹。并规定：养马1匹，免纳60亩地之田粮。每里置群长、兽医各1人。每死亡或丢失1匹寄养马，向“应役”者征银20两。久之，宝坻县此类负担累计白银不下万两，应役农民叫苦不迭。
天顺三年（1459年）三月，朝廷委派右参将都指挥金事马荣、监察御史李敏、工部主事李尚，调用药州诸卫宝纸等处军夫万人，发凿直沽河口至北塘河口之漕渠，历经13天渠成；同时派军甲5万名疏浚蓟运河。自此，方便了从天津直洁至蓟州的水路运输（至清初渠废，康熙三十四年于该渠故道北另开新河）。
成化五年（1469年）知县叶琪教民种桑养蚕，此为宝坻县养蚕之始。
弘治元年至十八年（1488一1505年）二年（l489），县内大水，饥民随处可见。
十年（1497），知县武尚信主持重修孔庙学宫，二月动工，五月完成。
十三年（1500），知县庄襗主待，百姓集资出役，改建县城土墙为砖墙，并建女儿墙、角楼、城门楼，挖护城河，设吊桥。此举用工逾万，耗银超千两，其它物料不计其数。
知县庄襗在县城北扩建义冢，占地10亩，城内贫民死后多在此埋葬。
十四年（1501），知县庄襗在县教谕齐济周、训导钱冕的协助下，在原高德稿本的基础上，修成《宝纸县志》，后世称《庄志》。这是宝纸县最早成书的县志。
十五年（1502）五月，知县庄襗在县内各河设渡船，计10艘，工役20人。宝坻县始有官渡。
期间，朝廷工部在县内设厂，称为工部厂。主要是采打芦苇，供给席片，用以苫盖皇木。并派中官监办，对县内民众横加勒索，闹得鸡犬不宁。
正德六年（1511年）农民起义领袖刘六、刘七、齐彦名等所率之农民起义军一部攻宝坻城，未克而返。
嘉靖元年至四十五年（1522一1566年）元年（1522），疏浚直沽河口至北塘河口之漕渠（今在宁河县境），同时加固蓟运河堤防。
三年至五年（1524至1526），对蓟运河分段实施清淤疏导工程。
十年（1531），县内大水。
十二年（1533），知县张元相在城西7.5公里处建桑园一所，占地20亩，赖以采桑养蚕。后年久荒废。
十四年（1535），知县武德智捐已俸购地2.6亩，在文庙前辟路（称“云路”）建桥（称“升仙桥”），方便了城内子弟入学。同年，武德智续修《宝抵县志》，未能定稿付印。
二十五年（1546），县内大水，庄稼无收。
三十二年（1553），县内大水，饥民大批出现。
三十三年（1554），知县刘廓在县城西门内建仿古社仓，用以贮粮。后废为民居。
三十六年（1557），县内大水，禾谷不收，知县胡与之发县城仿古社仓粮若干，赈济灾民。朝廷从宝纸县粮仓取栗若干，供给边关警兵。同年，胡与之续修《宝抵县志》，但仍然未能定稿付印。
三十九年（1560），县内蝗虫为害甚大，麦禾被食尽。
四十二年至四十四年（1563至1565），知县唐炼主持，修补城墙，疏浚护城河，恢复城西7.5公里处30年前原经知县张元相建立的桑园，四周筑墙，园内植桑数百株，并在城西1.5公里处择高地30亩，四周植柳，作为义冢，听任贫民瘗葬。又于四乡设免费私塾，供人子弟就读，宝纸县始有义学。
四十五年（1566），知县唐炼主持在县署设志馆，从县学中选拔杨愫、写李廷舄、苑因、芮蓂等四生员重修《宝纸县志》，当年告成，后世称为《唐志》。这是宝纸县继《庄志》之后，第二次刻印成书的县志。
隆庆二年（1568年）刘不息来宝坻任知县。任期（约为1568年至1570年）之某年，再次重修庙学，当年七月告成。
隆庆四年（1570年）夏涝为灾，损坏田禾，溺人畜甚众。
万历五年（1577年）知县丁应诏为减轻蓟运河洪患，导泃河水入鲍丘河，于三岔口筑石坝，堵截小漳河等山洪水入蓟运河。

万历十一年至十三年(1583—— 1585年)
知县管应凤督令人夫于县城四门增筑月城,复坞重雷,城益完固。是役自十一.年五月始.至
十三年十月成,共用工1.5万余个,耗银900余两。
万历十四年(1586年)
春夏间大旱，飞蝗蔽空,知县漆园率众捕蝗三十石.是年白姓大饥。.
万历十六年至十九年(1588——1591 年)
十六年(1588),雨多,河溢，百姓大饥,市间薪粒俱绝,官府讨税遏赋不休,民不聊生。
期内,知县袁黄于县内葫芦窝一带教民灌田种稻之法,并著《劝农书》一卷，为天津地区最
早的农业专著。乡民尊信其说.葫芦窝等一些村庄栽种了水稻.这是宝坻县种稻之始,但不久废
弃.改为旱田。直到清雍正间始又恢复。
期内,县民为生活计,生子多有私自阉割而后送入宫廷充太监者。知县袁黄对此严禁之。
万历二十一年(1593年)
县内重灾，民贫彻髓,草根树皮被吃尽。官府发梁城所的剩米5000多石(约50万公斤)及
县内预备仓、义仓贮谷若干，用以赈济灾民。
天启元年(1621年)
山阴(今浙江绍兴)人周黉鉴于历任宝坻县官吏多系江浙人.乃于县城建江淅乡祠,共三
楹,作为县内江浙籍官吏“祝匣饮福,兼祀祖考”的“期会”之所.
天启七年(1627年)
始自成化年间的“皇庄”(亦称“王庄”),此时在县境内已有多处,王公外戚在县内夺民田不
下120万亩.约占当时全县土地总数(不到200万亩)的60%以上。
崇祯二年(1629年)
冬,清兵攻宝坻城,知县史应聘集士民固守,城外金鼓动天，飞炮震地,史率众抵御,清兵攻
之不克,解围而去。
崇祯三年(1630年)
某日,县内发生龙卷风,雹沙眯目,扬屋石、头畜于河。
崇祯五年(1632年)
九月,顺天府宝坻等25州县淫雨害稼,民不聊生。顺天府尹刘崇嗣奏请朝廷急命户部与工
部会商,酌倩议定捐娠办法并加以实行。
崇祯九年(1636年)
七月,清兵猝攻宝坻城,知县赵国鼎率士民死守,待救不至,城破。城内男女死者数千，知县
赵国鼎、主簿樊枢、典史张六师、训导赵士秀均因被俘不屈而遭杀害。此役,后世称之为“丙子失守”或“丙子之难”。事后,宝坻县诸生陈应瑞于县城西门外以地12亩立冢,将死于战火的数千男女骸骼未火化者葬于是处,并作文祭之。
崇祯十四年(1641年)
朝廷漕粮运至直沽、北塘一带,安排转“陆运”进北京。宝坻县按上司命令,派马车600辆承
运，“数万粮一月报竣”。

（更新于2024年5月3日 未完·待续）